Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL9Q9P2J3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL9Q9P2J3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL9Q9P2J3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL9Q9P2J3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms