Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNRD1Q9P1U0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRD1Q9P1U0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNRD1Q9P1U0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNRD1Q9P1U0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNRD1Q9P1U0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms