Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNIH4Q9P003 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNIH4Q9P003 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNIH4Q9P003 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNIH4Q9P003 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNIH4Q9P003 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms