Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RDH8Q9NYR8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDH8Q9NYR8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDH8Q9NYR8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RDH8Q9NYR8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH8Q9NYR8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms