Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM160Q9NX00 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM160Q9NX00 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM160Q9NX00 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM160Q9NX00 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM160Q9NX00 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM160Q9NX00 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms