Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPRMQ9NS64 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPRMQ9NS64 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPRMQ9NS64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPRMQ9NS64 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms