Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARFGAP3Q9NP61 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARFGAP3Q9NP61 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARFGAP3Q9NP61 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGAP3Q9NP61 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms