Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SP140LQ9H930 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP140LQ9H930 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP140LQ9H930 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP140LQ9H930 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms