Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKD2Q9BZL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.51■■■□□ 2
PRKD2Q9BZL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKD2Q9BZL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKD2Q9BZL6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKD2Q9BZL6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKD2Q9BZL6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKD2Q9BZL6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms