Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TMEM106CQ9BVX2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM106CQ9BVX2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM106CQ9BVX2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMEM106CQ9BVX2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM106CQ9BVX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM106CQ9BVX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms