Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK2Q9BVS4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK2Q9BVS4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK2Q9BVS4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIOK2Q9BVS4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RIOK2Q9BVS4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIOK2Q9BVS4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms