Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POP1Q99575 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POP1Q99575 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POP1Q99575 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POP1Q99575 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POP1Q99575 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POP1Q99575 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POP1Q99575 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POP1Q99575 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POP1Q99575 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POP1Q99575 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POP1Q99575 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POP1Q99575 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POP1Q99575 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POP1Q99575 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POP1Q99575 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POP1Q99575 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POP1Q99575 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POP1Q99575 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POP1Q99575 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POP1Q99575 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POP1Q99575 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POP1Q99575 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POP1Q99575 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POP1Q99575 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POP1Q99575 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POP1Q99575 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POP1Q99575 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POP1Q99575 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POP1Q99575 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POP1Q99575 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POP1Q99575 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
POP1Q99575 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POP1Q99575 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POP1Q99575 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POP1Q99575 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
POP1Q99575 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POP1Q99575 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POP1Q99575 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POP1Q99575 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POP1Q99575 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POP1Q99575 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POP1Q99575 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POP1Q99575 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POP1Q99575 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POP1Q99575 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POP1Q99575 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POP1Q99575 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POP1Q99575 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POP1Q99575 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POP1Q99575 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POP1Q99575 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POP1Q99575 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POP1Q99575 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POP1Q99575 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POP1Q99575 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POP1Q99575 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POP1Q99575 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POP1Q99575 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POP1Q99575 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POP1Q99575 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POP1Q99575 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POP1Q99575 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POP1Q99575 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POP1Q99575 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POP1Q99575 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POP1Q99575 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POP1Q99575 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POP1Q99575 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POP1Q99575 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POP1Q99575 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POP1Q99575 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POP1Q99575 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POP1Q99575 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POP1Q99575 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POP1Q99575 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POP1Q99575 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POP1Q99575 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POP1Q99575 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POP1Q99575 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POP1Q99575 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POP1Q99575 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POP1Q99575 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POP1Q99575 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POP1Q99575 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
POP1Q99575 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POP1Q99575 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POP1Q99575 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POP1Q99575 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POP1Q99575 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POP1Q99575 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POP1Q99575 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POP1Q99575 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POP1Q99575 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POP1Q99575 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POP1Q99575 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POP1Q99575 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POP1Q99575 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
POP1Q99575 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POP1Q99575 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms