Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC46A1Q96NT5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC46A1Q96NT5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC46A1Q96NT5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC46A1Q96NT5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC46A1Q96NT5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms