Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLUHP3Q96NS8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUHP3Q96NS8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLUHP3Q96NS8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLUHP3Q96NS8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms