Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM74Q96NL1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM74Q96NL1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM74Q96NL1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM74Q96NL1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM74Q96NL1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms