Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
JPH4Q96JJ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
JPH4Q96JJ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
JPH4Q96JJ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
JPH4Q96JJ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
JPH4Q96JJ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
JPH4Q96JJ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
JPH4Q96JJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
JPH4Q96JJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
JPH4Q96JJ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
JPH4Q96JJ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
JPH4Q96JJ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
JPH4Q96JJ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
JPH4Q96JJ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
JPH4Q96JJ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms