Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED30Q96HR3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED30Q96HR3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED30Q96HR3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED30Q96HR3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms