Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA1

POM121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121Q96HA1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POM121Q96HA1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POM121Q96HA1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POM121Q96HA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POM121Q96HA1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms