Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC97Q96F63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC97Q96F63 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC97Q96F63 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC97Q96F63 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms