Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH3KBP1Q96B97 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3KBP1Q96B97 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3KBP1Q96B97 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3KBP1Q96B97 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms