Protein–RNA interactions for Protein: Q96AK3

APOBEC3D, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3DQ96AK3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC3DQ96AK3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3DQ96AK3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3DQ96AK3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3DQ96AK3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3DQ96AK3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms