Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL3LQ92901 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3LQ92901 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3LQ92901 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3LQ92901 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL3LQ92901 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms