Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSC1Q92574 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TSC1Q92574 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSC1Q92574 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSC1Q92574 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSC1Q92574 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSC1Q92574 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms