Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPATA18Q8TC71 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPATA18Q8TC71 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA18Q8TC71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPATA18Q8TC71 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms