Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA1Q8N8W4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNPLA1Q8N8W4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNPLA1Q8N8W4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNPLA1Q8N8W4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms