Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00337Q8N6G1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00337Q8N6G1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms