Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PARP9Q8IXQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP9Q8IXQ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PARP9Q8IXQ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP9Q8IXQ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP9Q8IXQ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms