Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APLFQ8IW19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APLFQ8IW19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APLFQ8IW19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APLFQ8IW19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APLFQ8IW19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms