Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HERC6Q8IVU3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC6Q8IVU3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC6Q8IVU3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HERC6Q8IVU3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HERC6Q8IVU3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HERC6Q8IVU3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HERC6Q8IVU3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms