Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SFR1Q86XK3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SFR1Q86XK3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SFR1Q86XK3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SFR1Q86XK3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFR1Q86XK3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SFR1Q86XK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms