Protein–RNA interactions for Protein: Q86X10

RALGAPB, Ral GTPase-activating protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPBQ86X10 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RALGAPBQ86X10 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RALGAPBQ86X10 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RALGAPBQ86X10 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RALGAPBQ86X10 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RALGAPBQ86X10 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RALGAPBQ86X10 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RALGAPBQ86X10 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RALGAPBQ86X10 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RALGAPBQ86X10 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RALGAPBQ86X10 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RALGAPBQ86X10 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RALGAPBQ86X10 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
RALGAPBQ86X10 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RALGAPBQ86X10 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RALGAPBQ86X10 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RALGAPBQ86X10 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RALGAPBQ86X10 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RALGAPBQ86X10 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RALGAPBQ86X10 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RALGAPBQ86X10 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms