Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RASSF3Q86WH2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASSF3Q86WH2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RASSF3Q86WH2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RASSF3Q86WH2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms