Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF554Q86TJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF554Q86TJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF554Q86TJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF554Q86TJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF554Q86TJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF554Q86TJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms