Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CTU1Q7Z7A3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTU1Q7Z7A3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTU1Q7Z7A3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTU1Q7Z7A3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTU1Q7Z7A3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTU1Q7Z7A3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTU1Q7Z7A3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTU1Q7Z7A3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CTU1Q7Z7A3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTU1Q7Z7A3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTU1Q7Z7A3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTU1Q7Z7A3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTU1Q7Z7A3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTU1Q7Z7A3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTU1Q7Z7A3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms