Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPCAT2Q7L5N7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPCAT2Q7L5N7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPCAT2Q7L5N7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPCAT2Q7L5N7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LPCAT2Q7L5N7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPCAT2Q7L5N7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms