Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP34Q70CQ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP34Q70CQ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP34Q70CQ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP34Q70CQ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP34Q70CQ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP34Q70CQ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP34Q70CQ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms