Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SRCAPQ6ZRS2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SRCAPQ6ZRS2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SRCAPQ6ZRS2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SRCAPQ6ZRS2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SRCAPQ6ZRS2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SRCAPQ6ZRS2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SRCAPQ6ZRS2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SRCAPQ6ZRS2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SRCAPQ6ZRS2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRCAPQ6ZRS2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SRCAPQ6ZRS2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SRCAPQ6ZRS2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SRCAPQ6ZRS2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms