Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPTNQ6XPR3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPTNQ6XPR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPTNQ6XPR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPTNQ6XPR3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPTNQ6XPR3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms