Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNIH2Q6PI25 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNIH2Q6PI25 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH2Q6PI25 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNIH2Q6PI25 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH2Q6PI25 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms