Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMBRD2Q68DH5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMBRD2Q68DH5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMBRD2Q68DH5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMBRD2Q68DH5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMBRD2Q68DH5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMBRD2Q68DH5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms