Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
RPRD2Q5VT52 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RPRD2Q5VT52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RPRD2Q5VT52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RPRD2Q5VT52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RPRD2Q5VT52 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RPRD2Q5VT52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RPRD2Q5VT52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
RPRD2Q5VT52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms