Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5VSD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5VSD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5VSD8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q5VSD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q5VSD8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q5VSD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q5VSD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q5VSD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q5VSD8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q5VSD8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q5VSD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q5VSD8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q5VSD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5VSD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5VSD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5VSD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5VSD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5VSD8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5VSD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q5VSD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q5VSD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q5VSD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q5VSD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q5VSD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q5VSD8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q5VSD8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q5VSD8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q5VSD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q5VSD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q5VSD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q5VSD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q5VSD8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q5VSD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q5VSD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q5VSD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q5VSD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q5VSD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q5VSD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q5VSD8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5VSD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5VSD8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q5VSD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5VSD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5VSD8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5VSD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5VSD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q5VSD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5VSD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5VSD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5VSD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5VSD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5VSD8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q5VSD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5VSD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5VSD8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5VSD8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q5VSD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q5VSD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5VSD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q5VSD8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5VSD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5VSD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5VSD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q5VSD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q5VSD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5VSD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5VSD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5VSD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5VSD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5VSD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5VSD8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5VSD8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q5VSD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5VSD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5VSD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5VSD8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5VSD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q5VSD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5VSD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5VSD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5VSD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5VSD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q5VSD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5VSD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5VSD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5VSD8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q5VSD8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5VSD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5VSD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5VSD8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q5VSD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms