Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CAMSAP1Q5T5Y3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CAMSAP1Q5T5Y3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
CAMSAP1Q5T5Y3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CAMSAP1Q5T5Y3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CAMSAP1Q5T5Y3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CAMSAP1Q5T5Y3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CAMSAP1Q5T5Y3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CAMSAP1Q5T5Y3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms