Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q5PR19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5PR19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5PR19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5PR19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5PR19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5PR19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5PR19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q5PR19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q5PR19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q5PR19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q5PR19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5PR19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5PR19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5PR19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5PR19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5PR19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q5PR19 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q5PR19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q5PR19 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q5PR19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q5PR19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5PR19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q5PR19 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5PR19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5PR19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q5PR19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q5PR19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q5PR19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q5PR19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q5PR19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q5PR19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q5PR19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q5PR19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q5PR19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q5PR19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q5PR19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q5PR19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q5PR19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q5PR19 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q5PR19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q5PR19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q5PR19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5PR19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5PR19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5PR19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5PR19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5PR19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5PR19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5PR19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5PR19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5PR19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5PR19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5PR19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q5PR19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q5PR19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q5PR19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q5PR19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5PR19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5PR19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5PR19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5PR19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5PR19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5PR19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5PR19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5PR19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5PR19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5PR19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5PR19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5PR19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5PR19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q5PR19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q5PR19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q5PR19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q5PR19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q5PR19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q5PR19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q5PR19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q5PR19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q5PR19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q5PR19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q5PR19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q5PR19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q5PR19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q5PR19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q5PR19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q5PR19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q5PR19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q5PR19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q5PR19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q5PR19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q5PR19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q5PR19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q5PR19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q5PR19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q5PR19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q5PR19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q5PR19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q5PR19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q5PR19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms