Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms