Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPEL1Q2QD12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPEL1Q2QD12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPEL1Q2QD12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPEL1Q2QD12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms