Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBX1Q14549 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GBX1Q14549 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GBX1Q14549 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBX1Q14549 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBX1Q14549 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBX1Q14549 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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