Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SHROOM2Q13796 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SHROOM2Q13796 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
SHROOM2Q13796 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
SHROOM2Q13796 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SHROOM2Q13796 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.38■■■■■ 4.38
SHROOM2Q13796 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
SHROOM2Q13796 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SHROOM2Q13796 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SHROOM2Q13796 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SHROOM2Q13796 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
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