Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.25■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC47.24■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC47.21■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
HMGXB3Q12766 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC47.16■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
HMGXB3Q12766 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC47.09■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.08■■■■■ 5.13
HMGXB3Q12766 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
HMGXB3Q12766 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC47.04■■■■■ 5.12
HMGXB3Q12766 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
HMGXB3Q12766 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC47.03■■■■■ 5.12
HMGXB3Q12766 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
HMGXB3Q12766 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.12
HMGXB3Q12766 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47■■■■■ 5.12
HMGXB3Q12766 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.12
HMGXB3Q12766 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC46.99■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
HMGXB3Q12766 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC46.94■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC46.91■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
HMGXB3Q12766 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC46.86■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC46.84■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
HMGXB3Q12766 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC46.78■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
HMGXB3Q12766 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC46.75■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC46.73■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC46.73■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
HMGXB3Q12766 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
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