Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNP2Q05952 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNP2Q05952 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNP2Q05952 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TNP2Q05952 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms